今一時的に日本に帰ってきてます。8月31日にカナダに戻る予定ですがビザが8月31日で切れてしまいます。もう申請する準備は出来ています。日本に帰ってくる前にするつもりでしたができなかったので、日本で赤坂のカナダ大使館に送るよていです。申請料もカナダで払ってきました。これでカナダ大使館（赤坂）に送っても大丈夫でしょうかね？？

微妙ですね・・・というのもビザ申請はアルバータ？に遅くとも１ヶ月前までには提出しなければならなかった記憶があります。ちなみにビザの受け取りは日本でされるのですか？もし８月末までのビザで８月中にカナダに戻ってくる場合カナダ入国の際、色々質問されるかと思います。（ビザをもっていれば別ですが）入学許可証などもそろっているんですよね？１日も早くカナダ大使館へ問い合わせすることをお勧めします。もらえることを願ってます。 　

充分間に合います。
カナダ大使館の人曰く、
「現地で取るなら6（QC州）・7月（他州）中に、日本で取るなら7月か8月始めまでに書類を出して下さい。」とのことです。