どの方法がベストなのかわかりませんが、
私はカナダにビジタービザで滞在しながら、国外に申請しました。
取得まで、TOTAL 7ヶ月位だったでしょうか。
あまり良く覚えていませんが・・・・、
「日本はマニラに申請」とありますが、郵便事情等、ちょっと心配だったので、ダメモトで日本の住所でカナダからアメリカのバッファローに申請しました。
インタビューの場所はいくつか選べたと思うのですが、すべてアメリカ国内(例えばシアトルとか)を希望しました。(私の場合、インタビューはありませんでした)
日本の住所で申請したので、受領確認や FILE No. の書類は日本に送られてきましたが、何通かはカナダ国内の夫の住所へ送られてきました。
健康診断が受けられる日本国内の指定病院リストも一緒に送られてきましたが、私はカナダ国内にいたので、
http://www.cic.gc.ca/ でカナダ国内の指定病院を探して、そこで受けました。
国内申請だと、申請中でもメディカルに入れるから、ためしに行ったのですがだめでした。
(最後に移民ビザが送られてきたとき(確かカナダ国内の夫の住所へ)、申請用紙と一緒に送った結婚式の写真も戻ってきました。かなりびっくり!)
申請中、ビジタービザが切れそうになったので、通常のビザ延長申請(アルバータ州へ)をしました。その際、本当に結婚したという写真等も添付しました。念には念を入れて・・・。あっ、でもこれは戻ってきませんでした(笑)
とまぁ、こんな感じでした。
よくわからない日本語でごめんなさいっ。
色々とややこしいですけど、頑張ってくださいね。