アプリケーションの何かを止めればいいと聞いたのですがさっぱり意味がわかりません。だれか教えてください！！ちなみにＷＩＮ９８です。

普段使わないようなソフトをアンインストールして、デフラグかければ少しは早くはなるのではないでしょうか？
　

ハードディスクがいっぱいになってきてないですか？ 　

単純に常駐を切ればいいのですよ

ファイルを指定して実行→msconfig→スタートアップにあるチェックを全てはずす 　

Res.3さんに少し付け加えると、全てのチェックを外すのはちょっとまずいです。
IMEやグラフィックカードに関するものも含まれていますので。
タスクバーにスタートアップ時に必要なものと必要でないものを見分ける必要があります。
例えば、RealPlayerやQuickTimeなどはここに入っていなくてもいいのでチェックを外しても結構です。 　

RealPlayerやQuickTime以外に外しても大丈夫なのって何がありますか？Microsoftなんかは外してもOKですか？ 　

Microsoftは基本的に外しても問題ないです。なにか不都合が出たら、一個づつ変更を加えたチェックボックスを戻して再起動････として、原因のスタートアップを元に戻しましょう。

　アンチウィルスソフトはチェック外してはいけません。最近ウィルスが物騒なので特に。