どちらも「もちろん」と言う意味があると思うんですが、文脈によって使い分けなければいけないんでしょうか？教えてください。

「Ｙｏｕ　ｂｅｔ」は、「もちろん」、「当然」っていう意味があり、「Ｉ　ｂｅｔ」は、状況や言い方にもよりますが、「ホントに〜？」とか、「うそばっかり〜」って、ジョークっぽくありつつ疑ってる感じもあります。

たとえば、友達が、「Ｉ　ａｃｅｄ　ｍｙ　ｂｉｏ　ｔｅｓｔ！」と言った場合、「Ｉｂｅｔ　（ｙｏｕ　ｄｉｄ）．」と言ったりします。