無回答さん、こんにちは。
日系大手N社さんのツアーは安いと思います。他の旅行会社さんも扱ってられると思いますが、私が知る限りではホワイトホースの商品では一番安いかも知れません。
タキーニ温泉に自力で行けるか?に関してですが、一度下記のURLにアクセスされてはどうでしょう?確か一般に解放されているのは木曜から日曜までで、曜日によってOPEN時間は違ったと思いますが、閉まるのは22時だったと思います。日系の旅行会社が扱っているパッケージのオーロラ鑑賞は23時から3時までの4時間を予定しており、市内からの送迎を含みますので実質温泉にいるのは3時間程、曜日も毎日では無く、日・水・金曜日のみ温泉でのオーロラ鑑賞だったと思います。この時はツアーの為に貸切になる為に、一般の方は入れなかったと思います。
なので、夜中は一般には解放されていない事になりますよね。ちなみに、ホワイトホース市内からのオーロラ鑑賞のツアー(要するに、日系のパッケージと一緒になるわけです)は、1人$100くらいだったと思います。送迎と温かいドリンクやスープなども込みになっています。
http://www.takhinihotsprings.yk.ca/ご自身で、ホテルを取られるのが、そこだけ見ると一番安いのでしょうが、日系のパッケージが安いのか、ご自身での手配旅行のほうが安いのか、検討の余地はありそうですね。
また、わからない事があればご連絡下さい。