トロントからニューヨークまでバスでいこうと思っているのですが、バスのチケットの手配の仕方とか、どこから乗ってどこに着くのかとかいろいろとわからなくて困っています。しっている方、教えてくださいな。

今、ＮＹに行くのはやめた方がいいと思います。 　

確かに今行ってもどうかなとは思いますが、もし絶対行きたいのであれば簡単です。
チケットはトロントのバスティーボ（Dundas×Bay付近）で予約ナシで買えます。
私はグレイハウンドを使いました。おそらくグレハンしか運行してないと思いますが。
夜の8:30頃の便で行くと、向こうに朝の6時にはつきます。
なおISICを持っていたので、150$（往復）ちょっとだったと思います。持ってない場合は知りませんが200いかないと思いますが。
到着するのはN.Y.の8th×42thのバカでかいバスティーボです。
ただ私が行ったのは去年の今頃なので値段などは変わっているかも知れません。
それに私が行った時は国境を超える場合や、バスに乗り込む時のチェックなどは全然厳しくなかったのですが、今はどうか分かりません。
間違い無く相当厳しいチェックがあると思いますが。それで時間がかかるのではないでしょうか？まあ今の時期にN.Y.に行く人はそう多くはないと思いますが。 　

グレイハウンドの時刻表、料金などは、
こちらで調べられます。

http://www.greyhound.com/ 　

１２月のクリスマス前後とかでも予約はいらないですか？あと暗くなってから出発する（トロントからでもＮＹからでもどちらでも）のはやっぱり危ないんですか？それともバス乗り場のところにいたら安全なんでしょうか。 　

クリスマス前後はちょっと分かりませんね。予約が必要かは。
トロントのバスティーボはそんなにでかくないし、暗くなってからでも超安全です。
ただNYはバスティーボ周辺の治安はあんまりよろしくないとの噂です。
逆にNYではバスティーボ周辺をうろうろするのは危ないのでは？ 　

ということはNYを夜出発するバスに乗るのは危険だからやめておいた方がいいんでしょうか。何時くらいまでなら大丈夫なんですか？ 　

経験がないのでなんとも言えないのですが、私の場合は荷物がありすぎて明らかに旅行者とばれる風だったので、安全の為に昼ごろにでるバスに乗りました。実際ユースを出るのもA.M.11時だったし。
今は旅行者もまだまだ以前と比べると少ないだろうし、そんなに危険ではないのかも？現在は相当警備が強化されているみたいですし。
私が行った去年の11月くらいは9、10時でも人通りが絶えない感じだったのでそれくらいなら大丈夫じゃないでしょうか？
バスティーボまでイエローキャブを使うっていう手もあるしね。
ただ夜11時を過ぎてメトロに乗るのは止めておいた方がいいみたいです。 　

また質問があるのですが、グレイハウンドのバスは雪とかで大幅に遅れたりとかするもんなんでしょうか？ 　

雪の降るシーズンに利用した事ないのでちょっと分かりません。
常識的に考えれば多少は遅れるんじゃないでしょうか？