年間３０００ドルほどのカナダと日本での副業の純利益がありますが、
これは税金申告しなくてはならないでしょうか？
給料収入は2万ドルほどなのですが・・・

当たり前です。

しなくていいんじゃん？

ＣＲＡはちゃんと見ています、金額が大きくなったとき、過去にさかのぼって税金と、追徴金を請求します。友人はこれでひどいめにあった。

しなくていいでしょ。まじめにやったら馬鹿見ますよ。

日本での儲けは日本の口座の方へ残しています。

なので、こちらで申告していません。
自分のもたいして大きい額じゃないので。
カナダの方で引き出して使うわけでもないし。

カナダ人なら申告しなきゃ駄目ですけどね。

私も、まったく同じ事で悩みました。
片手間でやっている、ebayの売り上げが２万ドルを超えてしまい、しばらく考えました。
結論は、申告しました。
結局行き着くところは、申告した場合と、しない場合とでは、
総収入がいくらになって、いくら税金を払うのか、
どちらが徳で、合理的かが、ボトムラインです。

蛇足ですが、かつて一度、何年も前のリターンについて、調べられました。
何もやましい事が無かったので、事なきを得ましたが。
やっぱり気持ちの良い事ではありませんね。