ＩＥＬＴＳ過去2回受けましたが、1回目はListening7,Speaking6でしたので、再度受験したところListening6.5,Speaking7でした。この結果2枚提出して、良いほうの結果だけとってListening7,Speaking7として申請しても良いものか悩んでいます。もしくは1枚の成績証明書に収まるよう再々受験した方が良いのでしょうか？経験者の方のアドバイスお願いします！

＞この結果2枚提出して、良いほうの結果だけとってListening7,Speaking7として申請しても良いものか悩んでいます。

残念ながらできません。
CICのFederal Skilled Workersのマニュアルが今年8月に改訂になりましたが、その改訂版で次のように確認されています。

In terms of designated language test results, officers will NOT select the highest score for each language ability from a variety of test score submissions. It is always the most recent group of tests that will be considered by officer as it is the most current assessment of the applicant’s four language abilities.

（http://www.cic.gc.ca/manuals-guides/english/op/op06e.pdf、16ページ）