確かに電話して聞くか直接窓口で聞くのが一番早いと思いますよ。
でも、パートナーのビザの種類は保険に入れるか入れないかは関係ないはずです。
AHCIP のサイトは確認されましたか?
Who is eligible
http://www.health.alberta.ca/AHCIP/Q-who-is-eligible.html
移民申請中とのことですが、ビザは当然お持ちなんですよね?あなたのパートナーが 183 日以上有効なビザがあれば加入できますし、あなたは加入者の Married spouse なので Dependants として一緒に登録できるはずです。
でも、とにかく直接問い合わせるのが一番確かです。不安でいたってしょうがないし、無理な物は無理な訳ですからね。 JPCanada はおかしな人がたくさんいるし、テンポラリーワーカーを見下す傾向がある移民もいたりするので、100%確実な情報は大元に聞くのが一番ですよ。