日本の会社で有給休暇消化中、当然お給料が発生している
状態でランディングすると、
あとあと税金、年金やらで面倒なことになるのでしょうか？
このような状況でランディングされた方いらっしゃいましたら、
アドバイスお願いいたします。

> あとあと税金、年金やらで面倒なことになるのでしょうか？

それはないと思いますよ。

日本で休暇をとり、ランディングとそれに伴う手続き(PR, SIN, 等）を全て終えてからまた日本に帰ってきた人を知っています。

税金と年金はカナダと日本の協定により、ダブルで課税されたり年金がカウントされなかったりなどはないようになっています。

あくまでも人に聞いた話なので、実際に経験された人がいたら補足してください。 　

私はまだ永住権が降りていないのですが、決まったらトピ主さん同様、有給休暇をもらってランディングしようと考えています。

日本の年金／税金は不必要に面倒にはならないと移民弁護士さんから聞きました。
　

ありがとうございます。
会社側にいろいろ言われない限り、
大丈夫そうですね。 　

有給休暇中にランディングをした場合、
日本の住民票は、やはり退社後に抜く形になるのでしょうか？
　

住民票は、その住所に住むのをやめた時に転出届を出せばいいんです。

つまり引越しした時です。退社は関係ありません。