現在カナダ国内申請中です（６月末に申請）。急用で日本に一時帰国したいのですが、国内申請中は出られないことも知っています。仮に出たとしても、再入国に問題が生じる可能性もあるそうですが、どなたか同じシチュエーションで出られて、再入国された方いませんか？
どうしたらよいでしょうか？教えてください。

そんなのオフィサー次第。
ここで無事に入国出来た人がいたとしても、あなたも再入国出来るかと言うとそうではないだろうし。
　

私もオフィサー次第だと思います。他の方が無事に入国できてもあなたが同じとはかぎりませんからね。
急用とのことで気持ちはわかりますが、そもそも国内申請をした際に出れないことはわかっていたはずですから、緊急の場合の対応はイミグレ次第です。 　

日本での急用が大切か、移民権を取ることが大切か
どちらかにプライオリティを決めればいい。 　

私は移民が取れる１ヶ月ほど前に帰国しました。
観光ビザでない、残り２年のビザがあったためか何も問題なく入国でき、
その２週間後に移民も取れました。
でも質問者様を安心させる材料になるとは思いません。
これはあくまでも私はこうだった、、、というまでに過ぎません。
同じ経験がある人、そしてその結果がどうだったかを聞きたいとのことだったので
コメントしています。 　

ビジターだと再入国の保障はできないからやめたほうがいいってってCICに言われたことあります。
そのオフィサーは、ワークパーミットもってたら大丈夫って言ってましたが。
困りましたね。 　

みなさん、いろいろなご返答ありがとうございます。
主人とも相談して明日、領事館に相談することにしました。 　

領事館?日本の?何もしてくれないですよ。
カナダのビザなんて管轄外ですから。