新移民法では、Res.5さんのおっしゃるとおり、少なくとも1年以上合法に認められたビザをもっていないと、バッファローに申請できません。
http://www.cic.gc.ca/english/applications/skilled-mission.htmlに、申請先として選択できるビザオフィスについて記載されています。
Determine which Canadian visa office is responsible for:
- the country in which you are residing, provided you have been lawfully admitted to that country for at least one year;
or
-your country of nationality.
1年以上のビザがない場合は、国籍がある国の管轄オフィス、つまり日本人の場合はマニラにしか申請できません。