私はworking holiday visaで物流会社で働いています。
来年４月にVISAが切れるのですが、それ以降も今の会社で働きたいと思っています。会社側もサポートしてくれています。

ＰＲとアプライしようと思ったのですが、work experienceの項目で職務経験が１年以下なので、ポイントが0/24になってしまいます。手順として、Working holiday→Work Permit→Permanent Residence が１番望ましいのでしょうか？

PRをApplyとありますが、現在Skilled Workerとしてのポイントをクリアーしているのでしょうか？
現在のお仕事は、NOCリストのA,B,0に入っていますか？NOCリストのA,B,0「以外での職歴しかない場合」は、職歴としてカウント出来ないので・・・。
今の会社で来年の４月以降もJob Offerをしてくれるのでしょうか？ 　

もし今、スキルドワーカーで移民申請しても、4月までに移民権を手に入れるのは無理だと思うので、まずはワークを申請するのが良いと思います。
　

職務経験が１年未満の場合は申請資格がありませんので、
Work Permitの申請が必要になります。
申請資格はNOCのA,B,0の職種で１年以上ですので現在のお仕事がそれに該当するか確認して下さい。
該当しているのでしたら、会社側がサポートしてくれるということなので、Workの申請をされて１年経った時点で申請されてはどうですか？
（あくまでパスマークを超えていればですが）
Workを持っているのですからAEやAdaptabilityのポイントもつくでしょうから、
もしかするとその頃にはポイントクリア出来ているかも知れません。
　

投稿いただいた方、ありがとうございます。Work Permitを申請しようと思います。
もう一つ質問があるのですが、もしWork permitをとって今のVISAが切れる来年の４月以降もカナダに残る場合、４月の時点で一度カナダを出なければいけないのでしょうか？ 　

単にステータスの延長・変更の手続きをするだけなので、
カナダから出る必要はなかったと思いますよ。