もうすぐカナダに帰り、コモンローの申請をしようと思っていますが、今年中には結婚をする予定です。しかし今回ビジターvisaで入国する予定で、6ヶ月以内に式をあげれるか分からないので、とりあえずコモンローの申請をしようと言う事になったのですが、その場合、結婚した後にまた、移民局に結婚の申請をしなければいけなくなるのでしょうか？そして、申請料を支払わなければいけないのでようか？

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結婚後に結婚した旨を連絡するだけです。
書類の内容（マリッジステイタス）が変わるということですから。