去年にPRを取得しました。
PRは五年間の内、三年間はカナダにいないと剥奪されてしまうと聞いたのですが、保持する方法はあるのでしょうか？

「5年のうち2年」で、3年ではありません。
基本的には2年間（通算で）カナダ国内にいる必要がありますが、カナダ人の結婚相手（コモンローでも）と一緒にいる場合や、カナダの会社の国外支社などに勤める場合は大丈夫です。
細かいところはCICのサイトに説明があるはずですので、探してみてください。
２年以上カナダ国外に出ても、すぐに剥奪されるわけではないはずです（とりあえず理由を調べる審査があるはず）。 　

ＰＲカードが送られた際のペーパーを読めば書いてますよ。
読まずに捨てちゃったの？それがないなら移民局サイトにちゃんと記載されてるので必要部分を読むことでしょう。