2005年〜2006年ワーホリで滞在し、帰国して、約六ヶ月。この春にカナダに行き、婚約者と結婚し、移民申請をする予定です。日本の住民票は海外転出、という形にしてあります。

国内申請で、日本の警察証明書等ををバンクーバーの総領事館にいって申請しようと思っているのですが、その際に、住民票が今住んでいるところにないと、警察証明等の各種証明は取得できないのでしょうか？どなたか教えて下さい。

必要ないですよ。バンクーバー総領事館でも住民票は必要ないし、日本ででも最後に住民票があった都道府県で取れます（住民票の除票が必要です）。カナダにいらっしゃる直前に、日本で取得してきてもいいですね。

在バンクーバー日本総領事館：http://www.vancouver.ca.emb-japan.go.jp/jp/consular_j/certificates_j.htm

警視庁：http://www.keishicho.metro.tokyo.jp/tetuzuki/tokou/tokou.htm 　

なるほど！ではこのまま住民票が海外転出の状態で渡航します！
早速の回答、ありがとうございました！