こんにちわ。カナダ人のパートナーで、日本で婚姻届を出しました。そのあと、彼の日本の結婚ビザのためにカナダの領事館に結婚証明をだしたのですが、それはもうカナダ国内でも結婚したことになってるのでしょうか？？先週カナダに来ました。これから移民申請なんですが、もう一度ここカナダで市役所とかに行って結婚するんでしょうか？。。。どなたか教えていただけますでしょうか。お願いいたします。

結婚は一度だけです。もう一度結婚することはできません。
日本で結婚した時点で、カナダを含め、どこででも結婚したことになります。この話題は過去ログにたくさんありますので検索してみましょう。 　

１の方の言っている通り、カナダでもう一度結婚しなくて良いです。
カナダでナムさんの移民申請をする際、日本の戸籍抄本を使用します。ナムさんの戸籍抄本の備考欄にカナダ人と結婚してある旨記載してあるのでそれが証明となります。
ちなみに戸籍抄本はプロに翻訳してもらい、公証をつけてもらう必要があります。
　

＞ちなみに戸籍抄本はプロに翻訳してもらい、公証をつけてもらう必要があります。

バンクーバーにお住まいなら、日本総領事館で英文の出生証明書と結婚証明書を発行してもらえば、翻訳・公証は必要ありません。
http://www.vancouver.ca.emb-japan.go.jp/jpn/syoumei.html#kekkon