http://www.cic.gc.ca/english/skilled/qual-5.htmlにSkilled Workerのポイント配分があるので、これでご説明しますね。
就労ビザ切れによりなくなるのは、
Factor 5:Arranged Employmentの10点
Factor 6:適応性の上から4番目、Arranged Employment有りの5点
の計15点です。
トピ主さんがおっしゃっている「1年以上働いた経験がある」の5点(Factor 6の上から2番目)はなくなりません。