ワークビザの申請をしていれば、結果が出るまで続けて働けます。
友人が同じ状況だったので、東京のカナダ大使館に問い合わせたところ、4月16日付けで次のようなメールを受け取りました。
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貴方のワーキングホリデービザの有効期限内に就労許可証の申請が移民局に受理されていれば、
ワーキングホリデーの有効期限内に就労許可証申請の結果が出なかった場合でも、
ワーキングホリデービザの条件内において、就労許可証申請の結果が出るまで就労を継続することができます。
Foreign Worker Manual の 5.22 を参照下さい。
http://www.cic.gc.ca/manuals-guides/english/fw/fwe.pdf