初めましてみなさん。
現在ワーキングホリデービザに切り替えている状態でメキシコに2週間旅行に来たのですが、パスポートを盗難されてしまい、新しいパスポートは発行したのですがワーキングホリデーのビザが取り消しになる可能性を大使館の方でお聞きしたのですが、同じような境遇の方，居られましたらアドバイス頂きたいです🙇‍♂️
入国する際の手続きや必要書類など、もし詳しい情報をお持ちの方なにか情報の提供お願いいたします。

何のビザからワーホリビザに切り替えですか？
もし現在のビザが有効かつ、期限内にバンクーバーに入国予定なら特に問題ない気がします。
申請中のワーホリビザが取り消しでも再申請すればいいのではないかな？

観光ビザからIEC(ワークビザ)に切り替えています

それはあやしい感じがしますね。

基本的に申請してから新しいビザが下りるまでは国外に出ない方が良いとされてます。
再入国の際もめる確率高いから。

なぜこのタイミングでメキシコ旅行に行かれたのか分かりませんが、一筋縄では済まさなそう。
うまく行ったらラッキーだと思って今のメキシコ旅行を全力で楽しむのがいいと思います。

カナダ政府公認の移民カウンセラーか移民弁護士に相談した方が良いケースだと思います
パスポート番号が変わっている以上、もともと申請していたワーホリビザの申請者とあなたが同一人物であると証明するものが存在しないですし
変に揉めるとカナダに観光ビザですら再入国させてもらえない可能性も出て来るので、もしカナダ国内にまだ荷物があったり、部屋を借りている場合は問題が大きくなる可能性も
いずれにしてもこんな掲示板で素人の意見を聞いている場合ではない気がします