はじめまして。カナダ人の男性と結婚をして移民申請の準備中です。

改製原戸籍謄本の提出についてお伺いしたいことがあります。
私は親が離婚をしている為原戸籍が二種類あります。

１：父の個人情報なども含まれていて、私と母に×がついているもの、筆頭者は父の名前
２：父の個人情報はなしで私と母のみ、離婚し籍が変わったことが記載されていて、筆頭者は母の名前

です。（分かりにくい説明で申し訳ありません…）

戸籍謄本の筆頭者は母なので、やはり二つ目を提出するべきなのかなと考えています。
もし同じ様な境遇で移民申請をされた方や何かご存知の方おられましたら、どちらを提出したほうが良いのか教えていただきたいです。

よろしくお願いいたします。

すでに結婚しているのなら、

とぴ主さん筆頭者の、ご主人との婚姻の記載がある戸籍謄本を出すべきなのではないでしょうか

私なら両方出します。新戸籍の他に原戸籍が必要なんですよね。
後で父親の証明とか追加で提出要請を言われるのならまとめて全部出して翻訳も一気にしてもらったほうがいいかと。。郵送代など手数料もかかりますし。
ややこしそうならカバーレターを付けてなぜ2枚あるかを説明するといいと思います。
私も全然違う書類ですがカバーレターを付けました。
私もまだPR待ちです。
お互い頑張りましょう！

A copy and a certified translation of the “Kaiseigen Koseki Tohon”, including details of his/her birth, marriage, and divorce (if any). “Kaiseigen Koseki Tohon” is the original source document(s) of a re-established family register; all names of the family members, even the ones that have been removed due to death, marriage, change of residence, etc., must be included.

http://www.cic.gc.ca/english/information/applications/spouse.asp

念のため、1,2の両方提出された方が良いと思います。（後でまた追加で提出を求められると、また時間がかかるため）なぜなら、移民申請する際は、あなたを含めたあなたの家族に関する全員のHistoryが必要だからです。必ず今は、戸籍謄本と改製原戸籍（2011年以前の内容が表示されています）の提出を求められます。