カナダで国内申請をしようと思っているのですが、日本国内で準備しなければならない書類を教えて下さい。

また、戸籍謄本には二種類あるとのことで、私が筆頭者になったものと、父が筆頭者になったものどちらも必要なのでしょうか?

そして、戸籍謄本等の公的書類は発行から6ヶ月以内の原本であれば申請時、問題ないでしょうか？

分からないことばかりで、皆様からアドバイスがいただけるとありがたいです。

国外申請だと戸籍謄本と改製原戸籍謄本の２種が必要だったと思いますが、
国内だと戸籍謄本だけだったような気が。
必要書類は知らない内に変わっていたりするのでCICのサイトで
最新の公式情報をチェックしたほうがいいですよ。

なぜ国内申請をしようとされるのかは分かりませんが、
国内申請は２６ヶ月とかかかるので、絶対国外申請のほうがいいと思います。
カナダ国内にいても国外・国内両方での申請が可能です。
私は去年申請して大体８ヶ月で下りました。