USBデータの中のファイルの一部が消えてしまいました。

消してしまったわけではなく、先日USBを開くとファイルのタイトルとファイルの中身がバラバラになっていて、１つのファイルの中身だけが空になっていました。

USBも数年も使っているので、古いのが原因なのか、それともウイルスが原因でしょうか？
直す方法を知っている方がいたら教えてください。

理由はわかりませんが、「データ・復元」などで検索すれば無料の復元ソフトが見つかります。ラッキーだったらデータを取り戻せるかもしれませんね。

消え方がウィルスっぽいですね。
一回、ウィルスチェックした方がいいかも。

USBというのがUSBのフラッシュメモリ(USBメモリ)の事を指されているのであれば、フラッシュメモリは書き込みを繰り返すことで劣化していき、データが正常に保持されなくなります。
この場合にはデータが物理的に壊れているので、残念ながらそのUSBメモリからはデータの復元は出来ません。
例えば、1と書き込んだ処理を行って正常に書き込めた様に処理されるのにメモリ上の値が0のままという状態です。

ただ、この場合は該当の部分に書き込まれているファイルだけが影響を受けるはずなので、すべてのファイルがという事であれば、ウィルスでこの様な状況にする物もあるのかもしれませんが、そうであれば他のUSBメモリや外付けHDD、さらには使用しているPC上にも同様の症状が発生するはずです。ウィルスの場合もデータを破壊する事を目的としている事がほとんどでしょうから復元も難しいでしょうね。