自分で作ったロゴを、自分のサイトに載せたいと思っています。
タイトルや、アイコンなどです。
それにはどのようなプログラムが必要ですか？
どうやってアップロードするのでしょうか？

他のhtmlファイルと同じようにアップロードできませんか？
ソフトとしては、FFFTPとかが有名ですけど、画像ファイルだから必要というわけではありません。IEでもFTPにアクセスできますし。

htmlをアップロードしているのでなければ、HPスペースを提供している会社のFAQにでも載っていませんか？