初歩的な事かもしれないですが、例えば妹と同じ部屋（bedroom）を共同している場合、会話の中で、妹に(go to our bedroom)と言うのが自然なのでしょうか？それとも、私がその部屋に行く場合じゃないので、(go to the bedroom)と言うのが自然なのでしょうか？
go to your bedroomは違いますよね？その部屋を共同しているので。

英語に詳しい方、ネイティブのお友達がいる方、正しい英語教えて下さい。

come to my bedroom www

共同ベッドルームであれば、どれでも使えると思いますが、
our bedroomだとベッドも共有してるのかなって印象もあります。

親が子供をしかってgo to your room！とかgo to your bedroom!とか言うのはよく聞きます。共同でもyour roomと言ってもいいと思います。

そうですねぇ
妹や姉などと共同している場合、僕なら「go to our room」と言うと思います。同じ家に住んでいる人間と会話している場合、「bedroom」は少し堅い感じなので普段は「room」と言います。共同しているので「your room」は言わないのが普通です。そして家にベッドルームが１つより多い場合、いきなり「the bedroom」と言うとどのベッドルームを指してるかわからないので言わないはずです。

妹に「部屋に行きなさい」と命令しているのでしょうか？
だったらGo to your roomでいいと思います。Go to the roomでも相手はどの部屋を指しているのかわかっている状況なので間違いではないでしょう。
自分が部屋に行くのに妹に伝えるのであればI’m going to our roomになるかと。

ちなみに上の方が言っているようにわざわざBedroomと言わないでRoomで良いと思います。ただBedroomと言ったらベッドを共用？が意味不明です。そんなことないですから。

家の旦那は、I’m　gonna lay down と言っていますよ。

ちなみに、我が家は１ベッドルームで、勿論一緒に使っています。

↑lay downはI’m going to bed.と同じで寝るってことじゃないですか？？ただ単純にbedroomに行ってもらいたいなら、go to the bedroomでいいような気がします。roomだけだとどの部屋か分からないと思いますが･･･。