虹はどこから見るかによって色が異なる。って言うのは
Depending on where you see a rainbow, the colour varies.
って文法とか変ですよね？
whereの前に前置詞があるし・・でも「どこから見るかによって」というときに、なんとなくfromを使いそうな気もするんですが
わかる方教えてください。

Rainbow colors look different from where you see/from different angles.と言ってはどうでしょう？
　

Rainbow colors look different from where you see/from different angles.と言ってはどうでしょう？
　

変ではありません。
正しい文章です。
depend on の後には、名詞句または名詞節が来ます。
where you see a rainbow の文章全部が名詞節になっています。
場所を表すwhereです。

（日本語が正しいかちょっと不安です。名詞句だったか名詞節だったか、恥ずかしながらちょっと自信がありません。。。すみません。。。。。。。。。） 　

where の前に from をつけてもこの場合大丈夫だと思います。　fromをつけたほうが「〜から」という部分が説明できると思います。

もし from where だと変と感じるなら
Depending on where you see a rainbow from ....　とも言えると思います。