筋肉質な体の男性に対しての褒め言葉として、
What a sexy body!
You have a sexy body!
You sexy thing!
You have a good muscle!
You are hunky!

どれが一番適切ですか？

hunky とは別の意味(セックスの相手など）もあるそうなんですが、
単に、筋肉質でセクシーな体だね！と言いたい場合に使うには、どのように使ったらよいですか？

sexyという言葉はあまり使わないほうがいいと思います。

彼氏か、「遊んでもいいな」と思っている相手だったらいいと思いますが、ただの友達や知り合いに対して使うのはどうかと思います。発情しているのかと誤解されますよ。
　

You’ve got a toned muscle/body!
I can tell you are working out!

Don’t use "sexy". 　

sexyは誤解を招く言葉なんですね。
お教えくださってありがとうございます！！ 　

単純に、
You’re looking great!
が一番自然だと思います。

もう少し「筋肉質」なことに触れたいならこの後に、
You must work out a lot.
というのが、ほぼ決り文句のようです。
この場合のmustは「〜にちがいない」という意味です。

特に体格の大きい男になら、
You are so buffed！
ということもできます。

どのような状況でトピ主さんがこのような表現を使いたいのか、
どのくらい海外での生活経験があるのかわかりませんが、
相手が男性であろうと、他人の体型・体質について触れるときは十分注意したほうがいいです。ささいなことでも思わぬ誤解を招くことがあります。
　

u got the body!!! 　

Ｒｅｓ４さんが言われているように、You must work out a lot. が１番自然だと思います。

あまりボディー、ボディーと、体に焦点をあてていうのは、誤解されやすいので、ご用心です。色んな人がいますからね。