カナダの健康保険をいただく間3ヶ月間は日本の海外保険を購入したいと思っています。3ヶ月間の待機期間ではAIUその他の海外保険は使えますか？

渡航目的は何でしょうか？
海外旅行保険は、滞在期間全部に加入するのが原則ですし、日本へ戻ってくることが条件です。
したがって移民目的の渡航の場合は加入できませんし、一時滞在でも滞在期間の一部だけの加入は、保険会社は認めないと思います。

また加入時に虚偽の申告（渡航目的、既往症など）をした場合、保険契約が無効になりますので、保険料を払ったのに、保険金が支払われないということになります。

会社によって違うこともあるのでとりあえず相談してみてはいかがでしょうか？
　

目的は移民ではないです。ワークビザで一年間の滞在なので、カナダの保険に加入するまで3ヶ月かかります。その間保険に加入したので海外保険ですと加入は難しいですか？ 　

私は、カナダの保険会社で、Visitors　の保険に三ヶ月
加入しました。　約２００ドル（最低レベル保障）です。
＄２５，０００の医療費をカバーというものです。
私の場合、移民になってから、三ヶ月保険を待つ間ということで、この保険に入りました。　一度、カナダの保険会社のサイトを(日系とか）しらべてみるのもいいかもしれませんよ！　 　

もしよかったらそちらのサイトを教えていただけませんか？ 　

とりあえず、このjpcanadaのトップページに広告出してる保険会社を見てみては？

https://www.jpcanada.com/info/int_ins/hoken_01.html