最近、液体式の洗剤に変えました。

Tideに柔軟剤ダウニーが入っているタイプです。

いいにおいがするといいなぁ〜と思って買ったのですが、
タオルが、とてもとても使えないほどにおいます。
それも、良いにおいではなく、なんだか使用後におしっこのような
においになるのです。

始めは洗濯機が汚れてるのかな？と思ってCleanerで洗浄したり、
気のせいかと思ったり、もしかしたら乾燥機にすぐさま移さなかったせいかも？
などと色々試したのですが、改善できません。

他、衣類は問題ありません。
なぜかタオルだけ・・。まぁ、ぬれたタオルのにおいなので、衣類もぬらしたら
同じ臭いかもしれません。でも、乾いている時は全く問題ありません。

これは、洗剤のせいでしょうか？
それとも洗濯機のせい？？
今まで柔軟剤は、乾燥機に入れるタイプを使っていたので
洗剤は粉、臭いがないタイプを選んでいました。

何か良い知恵があれば教えて頂ければうれしいです。

洗剤のせいだとおもいます。

私も以前ファブリーズ入りＴｉｄｅを買ったことがあるのですが、おしっこのにおいとはいかないけどやはりにおいは変でした。
現在は普通のＴｉｄｅを使ってます。これで充分だと思います。

濡れた時に臭うなら、雑菌が繊維内で繁殖しているからです。

洗剤や柔軟剤だけでは脂や汗は完全に落とせませんし、雑菌も繁殖します。洗濯用漂白剤を使えば臭いが落ちるはずです。お湯が使えるなら洗濯時にお湯を使います。

脱水後に放置していると雑菌が繁殖するので、漂白剤を定期的に使わないなら早めに乾燥機に入れるなり、干したりするように心掛けないと、オシッコや濡れた犬の匂いがします。

半信半疑なら、タオルを熱湯で漬けおきしてみてください。

Res2さんの言われるとおり雑菌が増殖している可能性大かと思います。
我が家でもある決まったバスタオルのみ、使用後の濡れた状態で悪臭があり困っていました。結局、洗剤、洗濯層内の問題では解決せず、熱いお湯に酢＆重曹を加えた中にタオルを30分以上つけておき、その後洗濯してみると問題が解決しました。