始めまして。
今現在、ワーホリビザで入国し、バンクーバーにいます。

観光で入ってワーホリに切り替えると言うのはよく聞きますが、ワーホリビザから観光に切り替える人をあまり聞きません。

いったん出国して再入国すれば、自動的にビジターで入れると認識しているんですが…
その際何か制限や考えられる問題などあれば教えてください。

ワーホリが切れる30日前までに申請しなきゃダメですよ。
オンラインか郵送。

そうなんですね！
ありがとうございます！！

ビザ切れる二日前にエージェンシーがビジタービザの申請してくれました。
今は待ってる状態です。

最悪前日までに申請してしまえば、申請中になるのでビザなしでも問題ないとの見解らしいですが…

Res３はかなりリスキーです。
１．エージェントがきちんと期限内にやってくれる保証はない。（つまり、人任せは危険）
２．書類に不備があったらり、郵便事情で紛失されたりしたら、いきなり不法滞在になる。

↑
書類に不備があったとしても、ビザの結果が出るまでは
Implied Statusになるので不法滞在にはなりません。
また、配達証明付きで郵送すればビザが切れる前に延長手続きをした証明になるので、
万が一紛失があったとしてもそれで不法滞在になるということはありません。

書類に不備 ＝ 処理すらせずに返却＝申請すら無かった事、なのでその時点で不法滞在だと思うんですけどね。

普通書類に不備があったとしても「XXの書類を提出しろ」っていう手紙が来ますよ。
それだけで却下ということにはならないし、なったとしても
その手紙が来るまではImplied　Statusで合法滞在です。