JPのサイトでアパートを探そうと思って見ていたのですが、
いまいちカテゴリーの基準がわかりません。

ルームメイトとシェアメイトは何が違うんでしょうか？
一つのBDROOMを２人で使うのがシェアメイトですか？

貸し部屋とルームメイトもどのように違うのですか？

リビングなどに住んでくれる人を探している場合もあると
思いますが、基本的には貸し部屋があるから、ルームメイトを探しているのではないのでしょうか？
それとも、JPのサイトの貸し部屋の意味は、オーナーは全くそこに
住んでいないで、部屋だけ又貸しするような意味なのでしょうか？

わかる方教えてください。
お願いします。

しかし、JPの検索って結局自分の絞った検索内容以外のもゴロゴロ入っていて、使いづらいですね・・・。

ルームメイトとシェアメイトの差はよくわかりませんが、
リビングに住む場合ももちろんあります。その場合はきちんとその旨明記していると思いますが。
私も今リビングに住んでいますが、カーテン等で仕切っており、一応はプライベートを保てています。家に寝に帰るくらいなので私はこれで構わないのですが、きちんとしたプライベート空間に住みたいのであれば、個室を貸してくれる方と連絡を取った方がいいですね。
オーナーは一緒に住んでいる場合もあれば住んでいないこともあるそうです。私はオーナーも一緒に住んでいます。

あまりいい答えになってなくてすみません… 　

日本語でオーナーという意味が混乱しているようにおもうのですが。

オーナーとは本来、その物件の持ち主です。固定資産税を払っている人です。

でも、ときどき日本人の間で『オーナー』というと、その物件を借りているプライマリーのテナントのことをいうこともよくあるようですね。

貸し部屋というときは、家なりアパートのスイートなりを所有している人が一部屋あまっているのを貸すことをさします。ルームメイトやシェアメイトという場合は、家なりアパートを借りている人が、自分一人でレントは支払いきれないので、一部を又貸しするようなことです。または、連名でレンタルの契約書にサインをする場合もありますね。