今年4月に理由なしで2年働いた職場を解雇され、EI申請する気力がなく今まで来てしまいました。

7月に新しい仕事につくことができましたが、解雇されてから3ヶ月間はもちろん収入がなかったです。

もう9月になりますが、過去に遡ってEI申請はできるのでしょうか？

原則として、最後に働いた日から4週間を過ぎると受理されないと思います。
よっぽどの理由があれば別とのことですが、
トピ主さんは既に次の仕事を見つけているし、ダメじゃないかな。

EIのお金を貰うには、毎週仕事を探しているとリポートするのが条件です。
どの会社のどの仕事にアプライしたとかリポートします。
１週間で求人に３件ぐらいアプライする義務があります。
それなのでEIのお金が払われるのは毎週です。
それをしないとEIのお金は貰えません。
トピ主さんはそれをしていなかったので、難しいと思います。

ちなみに、EIを申し込んで日本へ里帰りやアメリカに旅行に行く人もいますが、カナダで仕事を探しているのが条件でEIからお金を貰えるので、トピ主さんの場合は急に「EIのお金を貰えますか？」と言われもカナダで求職のリポートをしてなかったので難しいですね。

そうですよね。
お二人共ありがとうございました。

次に解雇された時には直ぐにEIを申し込んだ方が良いですよ！
給料が$61,500以上なら、一週間に$650貰えますよ。
トピ主さんの場合には３ヵ月貰えたので、最高額で$7,800ぐらい貰えましたね。