銀行が遠いのと、対応があまりよくないので、
今もっている銀行口座Aから、違う銀行Bに新たに口座を作って変えたいなと考えていますが、その場合何かA銀行のペナルティなどありますか？

またA銀行にあるお金を全てB銀行に振込する場合は手数料かかりますか？

そしてA銀行の口座を閉じたい。
(そのままにしておくと日本と違って口座の維持費がかかりますよね？)

etransferか金額が大きいならチェックを書いて入金する。
チェックだと最終的にクリアになるまで１ヶ月ぐらいかかるらしいので、その間は口座が空になり、口座手数料がかかるかもしれません。
registered accountだと他行への引越しには１口座５０ドルぐらいかかると思います。

銀行にもよりますし、どんな口座かにもよります。
基本的にはchequing accountを閉じる場合、手数料がかかります。大抵、毎月の口座維持費くらいの金額です。

Etransferは限度額があります。もしされるなら自分の限度額をonline bankingで確認しましょう。

口座のお金を移動させる場合は、bank draftを発行するのが普通です。draftはguaranteed fundsなので、発行時点でお金が口座から出ますから、口座を閉じる時は丁度いいです。
Draftの手数料は銀行にもよりますが9ドルくらいです。
他の銀行のものなのでdraftがclearされるまで5business daysかかります。

Chequeだとすぐに口座からお金が出るわけではないので、口座からお金を出して口座を閉じる、というのが1日で出来ません。chequeもclearされるまで 5 business daysです。

外国のchequeだとかなり時間がかかります。

お二方、情報ありがとうございます。

思ったよりも手数料は高くなくてよかったです。e-transfer の限度額を調べてみます。