11月1週目に日本帰国予定です。
オープンしてるのは東京だけと思っていたのですが、
航空券を調べている際、北海道の新千歳空港が選択できました。

詳しく知っている方いらっしゃいますか？

詳しくはないけどググったら出て来ましたよ。

政府は、新型コロナウイルスの感染拡大を受けた出入国制限の緩和に向け、地方空港での検疫体制の強化に着手する。まずは中部、福岡、新千歳の３空港を対象に、それぞれ１日当たり数百人の入国者の検査に対応できる体制を整え、本格的な往来再開に備える。

https://www.yomiuri.co.jp/politics/20200919-OYT1T50208/

成田国際空港、羽田空港、関西国際空港、中部国際空港、福岡空港及び新千歳空港を利用して日本にご帰国する際の税関手続きには、電子申告ゲートがご利用いただけます。利用に際しては、あらかじめ、税関申告アプリをダウンロードしてください。

https://www.facebook.com/CGJSYD/posts/656933071574087/

予約する予定の航空会社に確認した方がいいですよ。
海外の空港で乗り換えて新千歳に入るのは可能だという記憶ですが、日本国内の乗り継ぎが可になっているようには思いません。
ちなみに本日時点のANAのサイトでは14日間の隔離前に国内の乗り継ぎはまだできないことになっています。

https://www.ana.co.jp/ja/jp/topics/notice200501/#anchor003

「日本の検疫体制強化について」参照

状況は変わって行くので、予約日に対して、自分が予約しようとしている航空会社に聞くのが安全だと思います。

さすがに国内乗り継ぎができないことは分かっているでしょう。
日本国外の経由便の話だと思いますよ。

みなさんお返事ありがとうございます。

国内乗り継ぎがまだ許されていないのですね。ありがとうございます。明日航空会社に確認してみます‼

もしよければ航空会社になんて言われたか教えてください。

調べた限りでは新千歳空港の帰国者数は９月まで６カ月連続で０だそうですよ。

今月いるのかどうかわからないけど。そもそも新千歳空港に行ける国際便があるのかすらもこの数字を見ると怪しい。

オンラインのエージェントとかだと無くなった路線のチケットを平気で売ってたりするので気を付けてくださいね。今の時期は多少値段上がっても航空会社から買った方がいいです。