TD Trust CanadaとScotiabankにそれぞれ自分名義の口座を持っていますが
手数料無料または安く資金移動するのはどのような方法がありますか？

e-transferだとメールアドレスが一つしか登録できず
この方法が使えず困っています。

TDから3000ドル程度Scotiaに移したいと考えています。

メールアドレスが一つしか登録できないから e-transfer できない、というのはどういう状況でしょうか？
受け取り側のメールアドレスは当然ながらどんなアドレスでも良いですし、何が問題になっているのか良くわかりません。

また自分宛てにパーソナルェックを切ることもできます。

ご回答ありがとうございます。
TDもScotiaも同じメールアドレスで登録しているため、
e-transferがうまくいかないと思っていました。

Sendor のメールアドレスと
Recipientのメールアドレスが同じでそれぞれ別の銀行に紐づいていても
e-transferできると知らなかったので改めて試してみます。

ありがとうございました。

受け取り側のメアドは、そのメアドを他の銀行で使っていようがいまいが、そんな事は一切関係なく、単にメールを送るためだけのものです。そこに張られたリンクを辿るためだけのものなので、何でも構いません。