self employedをはじめるにあたり銀行口座が必要なのですが、自分個人名義の口座とは別に会社名でアカウントは開けることは可能でしょうか？
口座名義、小切手など会社名で、私の個人（SIN番号など）と関連付けられないようにしたいです。
会社組織にしないと無理ですかね。。。
よろしくお願いします。

Solo proprietorである限りは会社と個人は同一とみなされるので無理です。

Corporationであったとしても、個人の資産を担保にお金を借りたり、固定資産を購入したりすると、個人と会社をざっくり切り離すのは難しいでしょう。しかし、それは個人を守るためでもあります。会社を立ち上げてから２年は“会社”が銀行からお金を借りることはできないと思いますので、それまでは会社名義のクレジットカードも難しいと思います。

どの体制を選ぶかは自由で、会社の規模や業績などは問題になりません。それぞれに良い点、悪い点がありますので、Business planを作成したらアカウンタントに相談してみてはいかがですか？それか、CRAのサイトに詳しく記載されているのをご確認ください。

上の方が言われる通り、会社組織として法人になっていない限り無理です。それができたら、誰でも適当な名前でアカウント開けちゃいます。
税金のことを考えても、普通に考えて、税法上登録されていない名前のアカウントを開くなど無理でしょう。
自営業の場合は、本名に屋号を併記する形になるでしょう。

透明人間になりたければビジネスもアンダーグラウンドエコノミーですべて現金にしなければ。
しかし難しい、仕入れなど。