不定期で仕事をしています。
雇用先とは2週間に一度チェックで給与をもらっていますが月に多くて300くらいです。

人の紹介で引き継ぐ形で手伝っていますが給与明細等はありません。
どうやらセルフインプロイ扱いのようです。

今年タックスリターンをしたいのですが総額はだいたい1000ドルくらいの、わずかな収入だったと思うのですが無知だったのですがチェック入金後のレシートを捨ててしまいハッキリとした金額がわかりません。

チェックには雇用主の名前のみ記入されており会社名はありません。
タックスリターンをするにあたり、正確な金額を相手も把握しているかもわかりません。

この場合、金額も少額なのですが適当な金額でもいいのか、どうにか正確な金額を聞き出したとしても給与明細や入金のレシートなどの証拠物がなくてもできますか？

雇用主に1年分の明細を出してもらえばよいだけです

チェックの入金後のレシートなんて、あってもタックスリターンには使えませんか

銀行の履歴でいくら入金したか分かりませんか？分からなければ、会社に聞いた方がいいです。

私も経験したことですが、
給料明細がなければ、日付と金額の表をエクセル(または手書き)で作って印刷し、会社の連絡先も書いておきます。(私は会社のウェブサイトを印刷しました)
それをタックスリターンの書類と一緒に送れば、CRAから直接会社の方に確認の連絡が行くと思います。