４月に空路でアメリカ旅行しました。その時の、ビザウエーバーの有効期限が７月中旬まで残っています。６月に休みが取れそうなので、陸路でシアトルに４日間くらい行く予定ですがボーダーでの緑色の申請書と６ドルは必要でしょうか？

必要です。

入国のスタンプに９０日後に日付が書かれていますよね？
それより前に陸路で入国ならいりません。

何度も経験していますので間違えありません。
（オフィサーが知らない人に当たれば別ですが）

私の場合は日本〜US〜カナダでのスタンプの９０日以内(むしろUS入国から10日以内)に陸路でUSに再入国(飛行機をUS国内から乗るの為に再通過)してメキシコに行った時には普通にI-94Wも書き$6USDも払いました。
90日のカウントが継続されるのはLandでメキシコかカナダに陸路で出国後30日以内の場合だけ・・・・だったはずと思って調べたら、陸路とか30日って文言が消えてますね。変わったんですかね。
https://help.cbp.gov/app/answers/detail/a_id/194/kw/can%20I%20visit%20canada

でも、こっちには30日以内ならI-94は持っとけと書いてあったり・・・。
https://help.cbp.gov/app/answers/detail/a_id/752/~/i-still-have-my-i-94

よく分からないのがCBPのルールだし、たった$6USDなんだから、払うつもりでいれば良いだけの話だと思いますが・・・。

皆さん教えていただきありがとうございます。

バスで行く予定なので、申請書とお金は用意しておこうと思います（時間がかかって遅れたりしたら大変なので）。３ヶ月以内なので大丈夫と思い、短い休暇をとろうと思っていたのですが、色々難しいと実感しました。

４月に空路でアメリカ国内旅行とのことで、ＥＳＴＡは申請してるということですよね？
陸で行くと＄６払う必要はあるのですが、ＥＳＴＡを申請してあると通常自分で記入するＩ−９４の紙は、オフィサーがタイプしてくれるので、手続きが早いですよ。ＥＳＴＡを申請してるからか、グリーンの紙ではなく白い紙でした＾＾が内容は同じです。

私はシカゴ、サンフランシスコ、NY、ハワイなどアメリカに空路で旅行した後、９０日以内に今度は陸路でシアトル、ベリングハムに買い物やポイントロバーツに荷物のピックアップに行っていますが、CBPのオフィサーが私のパスポートをめくり、有効な期限のスタンプが押されているので（I-94Wはありません）わざわざ降ろして書いたり、＄６の支払を言われたことは一度もありません。

逆に１週間でも切れていると（当然ですが）降りて＄６支払わなければなりません。I-94はグリーンではなく、白い紙、しかもオフィサーが私のパスポートをスキャンしたらESTAが有効なのが分かったので、コンピューターが勝手にI-94を作成してくれて、私が記入する必要はありませんでした。ESTAの有効期限が１ヶ月だったので、更新（というか再度登録）しておくように言われました。そうするとI-94を自分で書く手間が要らないからだそうです。書くために長い時間並ばないので、向こうにとっても面倒が少ないようです。

ということで、今まで１０回くらい空路の後で陸路（一度の空路の後で陸路二度や三度などもあり）入国がありますが、スタンプが有効の間は一度も呼び止められたことがありません。そのまま通過でした。

追加情報ありがとうございます。

ESTAは、こないだ再申請したばかりなので十分あります。一応、オフィサーに聞いてみます。だめだったら指示に従うようにします。