現在日本でバンクーバーでのホームステイ先を探しているのですが
信頼性が高くかつ、手数料の安いエージェントを探しています。

わがままな質問ですが良いエージェントがあれば教えてください。

また、e-mapleやここのjpcanadaのクラシファイドでのホームステイ
募集を利用したことがある方に聞きたいのですが、気をつける点などは
ありますか？

ココから探したら如何ですか？
http://www.ryugakuagent.com/index.html 　

とにかく見学に行くことをおすすめします。

日本で学校経由でエージェントに頼みましたが、紹介された家が学校から遠くて、対応も悪くて、結局キャンセルして、自分で探しました。

いろいろ見学してわかったことは、思ったより交通の便が悪かったり、家が汚かったり、ホームメイトがたくさんすぎたり、いろいろです。

なのでここの掲示板で短期滞在先を決めておいて、こちらに来てから長期滞在先を探すことをおすすめします。