グレハンのバスが、Vancouver Bus DepotにAM２時２５分に着く場合、ｵﾘﾝﾋﾟｯｸ期間中なら、普通にスカイトレインまだ乗れますか？
また、その時間から明け方まで、 Bus Depotの近くで女が一人でも安全に時間を潰せる場所や店などが、近くにありませんか？
教えてください。

http://tripplanning.translink.ca/hiwire?.a=iScheduleLookupSearch&LineName=999&LineAbbr=999

ダウンタウンに行かれるんですよね?
トランスリンクのHPによると、ダウンタウン行きスカイトレインの最終はエキスポラインの1時38分なので、ちょっと間に合わないかもしれないですね。
でも、ナイトバスは走っているので（バス停はスカイトレインの駅の外にあります）、ダウンタウンまでいけますよ。 　

Pacific Central Stationですよね？

そのあたりは夜中はかなり危険エリアですよ。男女関係なくそのあたりの夜中の一人歩きは避けた方がいいと思います。

到着時間頃にタクシーを呼んでおいて、ダウンタウンの２４時間空いているコーヒーショップなどに移動されるのがいいかもしれません。もしくは、すぐ近くにEdgewater Casinoがあります。深夜料金でも＄１０しないでしょう。カジノで遊ばなくてもとりあえずコーヒーなども飲め、寒さもしのげていいかもしれません。

朝になればSkytrainが動いているのでそれで戻れます。 　

その辺りは夜は危険で、しかも時間を潰せるところもありません。
RES.2さんのおっしゃる通り、タクシーでダウンタウンの安全なエリアまで行って、24時間営業のTim Hortonsなどで時間を潰した方がいいですよ。
家の旦那が今朝、グレハンでその時間に戻って来ました。タクシーでダウンタウンの自宅（アパート）まで戻って来ましたが、約$10だったそうです。
ダウンタウンのTim Hortonsは24時間開いているところも多い（Bread Gardenも）ので、後で取り返しのつかないことになって後悔するよりも$10くらいなら安全にいったほうがいいと思います。