今バンクーバーに住んでいて、冬にトロントに鉄道で旅行しようかと思っているのですが、どこかの旅行会社を使う方がいいのでしょうか？お勧めのルートなどありませんか？

↓こちらは？

http://www.navitourca.com/moose_network/tours.phtml?itemtype=T&tourid=T0013 　

トロントに行くだけだったら、鉄道なら１つしかルートはないし、
出発日も週３日しかないし、時間も決まってますよね。

３泊４日は結構長いですよ。
コンフォートクラスだと、たぶんシャワーとかないです（見なかった）。
私はそれが嫌でウィニペグに寄り道して２泊しました。

寄り道するならジャスパーとウィニペグがお勧めです。
時間帯的にも昼間で移動しやすいし、駅とダウンタウンの距離も近いので。
エドモントンは駅とダウンタウンが離れていて、駅前は何もありません。
他のところは時間帯が微妙だったと思います。

ただ、雪の季節だと、寄り道するのが果たしていいのかはわかりません。

トロント到着は20時予定ですが、平気で３〜４時間遅れます。
なので、到着日は遅くチェックインできて、駅からなるべく近いところにホテルを確保しておいた方がいいと思います。
私はユースホステルのドミトリーだったのですが、YH到着が24時近くなり、部屋に入るとみんな寝てて、荷物から着替えを出すのも音を立てないようにするのが正直大変でした（その日は着替えずに寝たような…）。

たしか今はキャンペーンとかでチケット割引とかあったような気がしますし、冬期はキャンレイルパスも結構安いと思います。（キャンレイルパスを使えば、鉄道往復も可能ですね）

食堂車は、夕食11.5ドル、朝食7.5ドルぐらいでした。昼食は忘れたけどその間ぐらい。
毎日食堂車は高くつくので、特に朝食はパンとかおやつは持ち込むといいかもしれませんね。
コーヒーとかキットカットなどのお菓子などは2ドルです。